到了17世纪70年代中期，牛顿又花费了5年多的时间从事炼金术实验。在几十年的研究后，牛顿将自己的见解写成了1200字左右的文章，名为《实验之论》，这是他这些年炼金术研究的精华。然而，正当牛顿对炼金术实验的探索有所起色时，一场突如其来的大火毁灭了一切。1677年至1688年冬之间的某天早晨，牛顿的实验室发生了火灾，大火烧掉了他辛苦搜集的炼金术文献。

　　很多人一直疑问，牛顿究竟在这个耗时30年的炼金术研究中得到了什么？或者炼金术与他真正的科学研究有什么联系吗？对此，我们很难给出确切的答案。但毋庸置疑的是，作为化学前身一部分的炼金术，必定给予了牛顿在其他方面研究的帮助。虽然炼金术本身是神秘色彩笼罩下的江湖术士行为，但其操作过程中的方法理论、现象研究都与正统的科学有着不可忽视的联系。炼金术里的“发气原理”，促成了牛顿想到物体间能有超距作用，而这是万有引力理论中的关键一环。“轩辕十四锑”也为牛顿打开地球引力之门助力，这些都与炼金术的研究和体会有关。正如迈克尔·怀特所说：“如果我们以20世纪末、21世纪初的冷静明智态度来审视炼金术，我们应该承认它带给了这个世界一些有用的技术与器具……最重要的是它至少激起一位伟大的17世纪哲学家的灵感，使他产生了一系列构思，单凭这一点我们就应该心满意足了。”

　　可惜的是，牛顿的炼金研究成果以被大火付之一炬，如果能够流传下来或许能给我们的科学带来更大的突破和创新。