这一法令从制定到推出，再到现在制定实施细则，细化管理名录等措施，存在着很多的立法缺陷。从某种意义上说，很多恶法的制定，都是由委托立法造成的。全国人大的委托立法，由于专业性强，委托专业部门起草，难免会形成部门利益的集团保护。

　　这一法令的制定，尤其是关于产权的界定，对古生物化石的发掘、收藏、流通、科研，乃至管理，会形成许多新的弊端。要解读《古生物化石保护条例》，就不能不说古生物化石收藏热，还有近年来古生物化石走私大案。

　　古生物化石收藏，在国外已经有几百年的历史。英国达尔文的进化论，就是建立在古生物化石收藏的基础上的。如果没有古生物化石的收藏，就不会有十九世纪三大科学发现，更不会有自然科学的进步。

　　我国古生物化石的收藏，主要局限于地质工作者群体，近年来在收藏市场才有流通。由于国外对古生物化石收藏有几百年的历史，国内收藏界对古生物化石的不重视，加上高额利润的引诱，导致了古生物化石走私猛增，而且有愈演愈烈的势头。如 ：2002年，美国无偿返还我国93箱海关截获的走私化石；2003年，深圳海关截获10吨2165件未申报的化石；2004年，澳大利亚截获了1300件，包括恐龙蛋、上古鸟类、鱼类的化石；2004年，杭州海关在宁波北仑港截获2925件化石；2006年，美国洛杉矶再次截获42箱古生物化石，主要是恐龙蛋，大部分保存相对完好。

　　利润，让走私横行。原产于我国的古生物化石，在走私的带动下，开始了大量的盗采盗掘现象，让古生物发掘现场遭到了严重的破坏，大量的科学研究信息流失。由于古生物发掘现场是不可逆的，走私与盗掘对古生物学研究带来巨大的影响。也正因为这种现象越来越猖獗，才促使地方政府和国家部委，开始制定《古生物化石保护条例》等一系列的法规。在古生物化石追缴的过程中，为了确立行政执法、司法审判的合法性，国家才把古生物化石产权，确立为国家所有。

　　远古时代的漫长时间，地形地质、气候条件的变迁，以及生物的多样性，大自然为人类留下大量的古生物化石遗迹。古生物化石并非奇缺资源，由于未被人类所全部认识，在某些人的眼里，化石成为了稀缺物品。

　　国家制定《古生物化石管理条例》，目的在于保护古生物化石，主要是稀缺或者珍贵化石，并不是保护所有的化石。作为普通的古生物化石收藏者，在个法规中看到，古生物化石产权属于国家，个人对于古生物化石的发掘、收藏、研究、流转，也就失去了合法性。然而，在现实当中，古生物化石虽然属于国家所有，但是属于三级重点保护以外的古生物化石，在县级以上指定单位又可以自由买卖，这和古生物化石属于国有资产的规定相违背，而且买卖收入究竟是归地方政府所有，还是归中央财政所有，并没有相关的法律规定。由于收入的指向性不明，就造成了古生物化石的流转、所产生的收益发生混乱，这样就会给相关的执法部门，提供灰色收入创造了契机。与此同时，也产生了行业的部门垄断，导致收藏市场价格的混乱。

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